Amsterdam Modeling Suite 已經釋出 2021 的第一個版本 AMS2021.1。除了增強既有模組,也新增許多新功能,其中自動化搜尋反應路徑是新版本的一大特點。

自動化搜尋反應路徑
Automated Reaction Pathway Search
AMS driver 中將加入新功能 PES exploration,可以使用各模組自動化搜尋過渡態(transition state)及局域最小值(local minima),並提供以下功能:
- Process Search:搜尋極小值及連接兩個極小值得過渡態
- Saddle search:搜尋附近的過渡態
- Basin hopping:搜尋局域最小值
- Landscape refinement:讓用戶使用不同的理論,微調先前計算的過渡態及最小值
- 找出團簇或表面的結合位點,並將其可視化
- 此新功能得使用,可以參考以下兩個範例:

ADF
- Polarizable force field:QM/FQ Quantum Mechanics/Fluctuating Charges
- Unrelaxed dipole moment excited states
- Transition dipole moment between extied states
- POLTDDFT for fast excitation spectra 可以支持更多元素
- New XC functional:r2SCAN-D4
- Eigenvalue-only self-consistent GW (evGW)
- New basis set:TZ3P and QZ6P for Many Body Perturbation Theory
- New Ligand-Field DFT (LFDFT) spectroscopy:ESR g-tensor doublets, XMCD

COSMO-RS
可以計算分子在不同狀態下的熱力學性質,例如:不同的質子化或解離狀態、異構物。細節可參考此連結
圖形化使用者介面 GUI
- Package manager:更方便管理外加套件,如: COSMO-RS 資料庫, Quantum ESPRESSO, Machine Learning Potential 等…
- Interactive termination:可以在模擬過程中,使模擬停止在當前步數或當前迭代數
- 增強圖形化介面處理多個分子的能力
- Molecule gun 新增 Sinkbox 及 Safebox 的功能

AMS driver 上的其他新功能
- Spherical wall potential:該勢能在球的半徑內為0,在球的半徑外具有向球心推動的力。具體使用設定參考此連結
- D4 dispersion correction:使 BAND 及 DFTB 模組也可支持D4 色散修正
- Force bias Monte Carlo:全模組皆可支援使用
- ForceField 模組效率優化:計算效率可以提高 2 到 3 個量級
- ParAMS 釋出:ReaxFF 與 DFTB 的參數擬和工具